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Hidrografía
El municipio de Valle de San José se encuentra en el área geográfica montañosa
de la cordillera oriental y delimitado por los cauces que discurren de Sur a Norte
así: por el Oriente con el río Guaure y las quebradas La Vega y La Jurupá, por el
Occidente el río Fonce, por el Norte el río Mogoticos que discurre de Oriente a
Occidente a tributar sobre el río Fonce, y por el sur la quebrada El Salitre que nace
en la divisoria de aguas de la quebrada La Sobacuta.
En flora son objeto de
conservación por estar amenazadas, el abarco, el caobo o caoba, el comino
crespo y el yumbé, de las cuales la Corporación Autónoma Regional de Santander,
CAS, decretó la veda de el carreto y el marfil.
También están priorizadas
siete más, de las cuales se destacan el lítamo real por ser una especie
endémica, el frailejón, una especie característica del área de páramos y el
roble negro.
En fauna, son objeto
de conservación en Santander y la Región Andina el paujil, en mayor riesgo, la
nutria gigante, el venado de páramo, el oso de anteojos, el mono araña y el
tigrillo peludo o tigrillo lanudo, el tigrillo común y el perro de monte o
marteja.
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